由于需要连续生产，国产气相色谱仪通常需要24小时运行。不会经常有机会清洁和维护仪器系统。如果有合适的机会，就需要根据仪器的实际操作对仪器的关键部件进行清洁和维护。

国产气相色谱仪通常用于有机物的定量分析。仪器运行一段时间后，由于静电，容易吸收仪器内部的更多灰尘。除了灰尘吸附在电路板和电路板插座上之外，它还经常与某些有机物结合在一起。由于某些有机物的凝固点较低，因此在国产气相色谱仪的注入口经常会发现固化的有机物。使用一段时间后，分流管道的内径会变薄，甚至被有机物堵塞。在使用过程中，TCD检测器比较，它可能被有机物污染；FID检测器长期用于有机物分析，并且有机物沉积在喷嘴或收集极上，或者经常出现碳沉积现象。

吹扫并清洁国产气相色谱仪内部：

关闭国产气相色谱仪后，打开仪器的侧面板和后面板，使用空气或氮气吹扫仪器的内部灰尘，并使用软刷处理不容易沾满灰尘的区域。吹扫完成后，用水或有机溶剂擦洗仪器内部有机污染的区域。对于水溶性有机物，可以先用水擦拭。对于无法彻底清洁的区域，可以使用有机溶剂进行处理。或与水发生化学反应的有机物质用不与之反应的有机溶剂清洗。需要注意的是，在擦拭国产气相色谱仪的过程中，不会造成腐蚀或二次污染到仪器表面或其他部分。

电路板的维护和清洁：

在准备进行国产气相色谱仪检修之前，需要切断仪器的电源。使用空气或氮气吹扫电路板和电路板插槽时，需要使用软刷清洁电路板和插槽上的灰尘部分。在操作过程中，需要戴上手套，以防止手上的静电或汗水影响国产气相色谱仪电路板上的某些组件。